改太史监为院，设院使，正三品；同知，正四品；院判，正五品；五官正，正六品；典簿、雨晹司、时序郎、纪候郎，正七品；灵台郎、保章正，正八品；副，从八品；掌历、管勾，从九品；以太史监令刘基为院使。
上谓侍臣曰：“吾自起兵以来，凡有所为，意向始萌，天必垂象示之，其兆先见，故常加儆省，不敢逸豫。”侍臣曰：“天高在上，其监在下，故能修省者蒙福，不能者受祸。”上曰：“天垂象所以警乎下人，君能体天之道，谨而无失，亦有变灾而为祥者。故宋公一言，荧惑移次；齐侯暴露，甘雨应期。灾祥之来，虽曰在天，实由人致也。“
朱亮祖兵至黄岩州，方国瑛烧廨宇民居，遁海上，守将哈儿鲁降。
辛亥，置长淮卫指挥使司于临濠。
赏克苏州将士有功者米有差。先是，王师攻苏州阊门、胥门之战，大将军徐达定赏格，出印帖付获功者，至是师还，奏之，命悉依所定格给之。
上敕礼官曰：“自古忠臣义士，捨生取义，身殁而名存，有以垂训于天下。后世若元右丞余阙守安庆屹然，当南北之沖，援绝力穷，举家皆死节义凛然；又如江州总管李黼身守孤城，力抗强敌，临难死义，与阙同辙。自昔忠臣义士，必见褒崇于后代，盖以励风教也。宜令有司建祠肖像，岁时祀之。”
壬子，置御史台及各道按察司御史台：设左、右御史大夫，从一品；御史中丞，正二品；侍御史，从二品；治书侍御史，正三品；殿中侍御史，正五品；经历，从五品；都事，正七品；照磨、管勾，正八品；察院监察御史，正七品；各道按察司按察使，正三品；副使，正四品；佥事，正五品；经历，正七品；知事，正八品；照磨，正九品。以汤和为左御史大夫，邓愈为右御史大夫，刘基、章溢为御史中丞，文原吉、范显祖为治书侍御史，安庆为殿中侍御史。钱用壬为经历，何士弘、吴去疾等为监察御史，基仍兼太史院使。上谕之曰：“国家新立，惟三大府总天下之政，中书政之本，都督府掌军旅，御史台纠察百司，朝廷纪纲，尽繫于此。而台察之任，实为清要，卿等当思正己以率下，忠勤以事上。盖己不正，则不能正人，是故治人者必先自治，则人有所瞻仰。毋徒拥虚位而漫不可否，毋委靡因循以纵奸长恶，毋假公济私以伤人害物。诗云：‘刚亦不吐，柔亦下茹。’此大臣之体也，卿等勉之。”又谕御史大夫汤和曰：“卿以武臣而位处文职，当求儒者讲论。自古人臣立身行己，事君治人之道，尽心所事，以成功业。他日名书史册，垂耀千载，岂不美哉！”和顿首谢。
命放广德府民义四百六十人归农。初，广阳、建平等县验丁出兵，谓之“民义”，以守广德。至是，上闻其妨农，悉放罢之。
癸丑，置定远卫亲军指挥使司，以庞龙、戈预为指挥佥事。
命御史大夫汤和为征南将军佥大都督府事，吴祯为副将军，帅常州、长兴、宜兴、江阴诸军讨方国珍于庆元。上谕之曰：“尔等奉辞讨罪，毋纵杀戮，当如徐达下姑苏，平定安辑，乃副吾所望也。”
右御史大夫邓愈等各言便宜事，上览之，谓愈等曰：“治天下当先其重且急者，而后及其轻且缓者。今天下初定，所急者衣食，所重者教化，衣食给而民生遂，教化行而习俗美。足衣食者在于劝农桑，明教化者在于兴学校。学校兴则君子务德，农桑举则小人务本，如是为治则不劳而政举矣。今卿辈所言，皆国家不可阙者，但非所急，卿等国之大臣，于经国之道、庇民之术，尚当为予尽心焉。”
甲寅，复遣使檄谕温、台、庆元之民曰：“庆元方国珍始由海上细民，因元失政，首倡祸乱，盗据三郡，兄弟子侄，伪列官曹，肆其贪虐，为民巨害。昔常遣人纳降，吾念尔民之故，即许之不疑。彼怀奸匿诈，旋即背叛，交构闽寇，犯我边疆。故命师往讨，罪止方氏，其他士民有诖误者，皆非本情，毋妄致疑，各归本业，有能仗义擒斩魁党来归者，吾爵赏之。”
命中书省定律令，以左丞相李善长为总裁官，参知政事杨宪、傅瓛、御史中丞刘基、翰林学士陶安、右司郎中徐本、治书侍御史文原吉、范显祖、经历钱用壬、监察御史盛原辅、吴去疾、赵麟、崔永泰、张纯诚、谢如心、大理卿周祯、少卿刘惟敬、大理丞周浈、评事陈敏、孙忠、按察使李详、潘黼、滕毅、佥事程孔昭、傅敏学、王藻、逯永贞、张引、吴彤为议律官。初，上以唐、宋皆有成律断狱，惟元不仿古制，取一时所行之事为条格，胥吏易为奸弊。自平武昌以来，即议定律。至是，台谏已立各道按察司，将巡历郡县，欲颁成法，俾内外遵守。命善长等详定，谕之曰：“立法贵在简，当使言直理明，人人易晓。若条绪繁多，或一事而两端，可轻可重，使奸贪之吏得以夤缘为奸，则所以禁残暴者反以贼良善，非良法也。务求适中，以去烦弊。夫网密则水无大鱼，法密则国无全民。卿等宜尽心参究，凡刑名条目，逐日来上，吾与卿等面议斟酌之，庶可以为久远之法。”
乙卯，上谓台宪官刘基、章溢、周祯等曰：“纪纲法度，为治之本，所以振纪纲、明法度者，则在台宪。凡揭纪纲法度以示百司，犹射者之有正鹄也，百司庶职操弓矢以学射者。于台宪乎取法，故审己不可以不慎，苟不知其本，察于小物而昧于大体，终非至正之道。尔等执法上应天象，少有偏曲，则纪纲法度废坏，而民不得其安。况或深文以为能，苛察以为智。若寗成、郅都、周兴、来俊臣之徒，巧诋深文，恣为酷虐，终亦不免；若于公阴德子孙，乃致贵显，天道昭然，深可畏也。”